MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 114291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009925	A	6	6	229480	229485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009925	GTT	2	6	229491	229496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_009925	A	6	6	229502	229507	100 %	0 %	0 %	0 %	158333460
4004	NC_009925	GGT	2	6	229795	229800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333460
4005	NC_009925	AAC	2	6	229839	229844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333460
4006	NC_009925	AGC	2	6	229874	229879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333460
4007	NC_009925	A	6	6	229894	229899	100 %	0 %	0 %	0 %	158333460
4008	NC_009925	CAA	2	6	229923	229928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333460
4009	NC_009925	A	6	6	229980	229985	100 %	0 %	0 %	0 %	158333460
4010	NC_009925	GGTG	2	8	230104	230111	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009925	TAA	2	6	230134	230139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333461
4012	NC_009925	TTG	2	6	230154	230159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333461
4013	NC_009925	CTTG	2	8	230171	230178	0 %	50 %	25 %	25 %	158333461
4014	NC_009925	CCG	2	6	230316	230321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333461
4015	NC_009925	AGG	2	6	230346	230351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333461
4016	NC_009925	TG	3	6	230395	230400	0 %	50 %	50 %	0 %	158333461
4017	NC_009925	CGT	2	6	230401	230406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333461
4018	NC_009925	TGT	2	6	230434	230439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333461
4019	NC_009925	ATC	2	6	230496	230501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333461
4020	NC_009925	CT	3	6	230550	230555	0 %	50 %	0 %	50 %	158333461
4021	NC_009925	ATTG	2	8	230574	230581	25 %	50 %	25 %	0 %	158333461
4022	NC_009925	GCAAT	2	10	230664	230673	40 %	20 %	20 %	20 %	158333461
4023	NC_009925	G	6	6	230830	230835	0 %	0 %	100 %	0 %	158333461
4024	NC_009925	ATC	2	6	230860	230865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333461
4025	NC_009925	TAGCAC	2	12	230978	230989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158333461
4026	NC_009925	AG	3	6	231063	231068	50 %	0 %	50 %	0 %	158333461
4027	NC_009925	T	7	7	231077	231083	0 %	100 %	0 %	0 %	158333461
4028	NC_009925	CTTGG	2	10	231173	231182	0 %	40 %	40 %	20 %	158333462
4029	NC_009925	CTGA	2	8	231388	231395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_009925	GCT	2	6	231469	231474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333463
4031	NC_009925	CTTG	2	8	231492	231499	0 %	50 %	25 %	25 %	158333463
4032	NC_009925	AGC	2	6	231561	231566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333463
4033	NC_009925	AAT	2	6	231713	231718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333463
4034	NC_009925	T	8	8	231727	231734	0 %	100 %	0 %	0 %	158333463
4035	NC_009925	AATC	2	8	231780	231787	50 %	25 %	0 %	25 %	158333464
4036	NC_009925	GATTT	2	10	231814	231823	20 %	60 %	20 %	0 %	158333464
4037	NC_009925	GAA	2	6	231982	231987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333464
4038	NC_009925	T	6	6	232073	232078	0 %	100 %	0 %	0 %	158333464
4039	NC_009925	GCG	2	6	232092	232097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333464
4040	NC_009925	ATTTT	2	10	232113	232122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_009925	GAA	2	6	232164	232169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009925	TTAA	2	8	232200	232207	50 %	50 %	0 %	0 %	158333465
4043	NC_009925	T	6	6	232218	232223	0 %	100 %	0 %	0 %	158333465
4044	NC_009925	TCC	2	6	232315	232320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333465
4045	NC_009925	TCT	2	6	232342	232347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333465
4046	NC_009925	TCT	2	6	232408	232413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333465
4047	NC_009925	TCG	2	6	232453	232458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333465
4048	NC_009925	A	7	7	232488	232494	100 %	0 %	0 %	0 %	158333465
4049	NC_009925	C	6	6	232552	232557	0 %	0 %	0 %	100 %	158333465
4050	NC_009925	CTTG	2	8	232564	232571	0 %	50 %	25 %	25 %	158333465
4051	NC_009925	GAGG	2	8	232651	232658	25 %	0 %	75 %	0 %	158333465
4052	NC_009925	TCTA	2	8	232683	232690	25 %	50 %	0 %	25 %	158333465
4053	NC_009925	ATC	2	6	232713	232718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333465
4054	NC_009925	GT	3	6	232745	232750	0 %	50 %	50 %	0 %	158333465
4055	NC_009925	T	6	6	232750	232755	0 %	100 %	0 %	0 %	158333465
4056	NC_009925	TTC	2	6	232826	232831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333465
4057	NC_009925	TGC	2	6	232854	232859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333465
4058	NC_009925	CTC	2	6	232894	232899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_009925	AATA	2	8	232932	232939	75 %	25 %	0 %	0 %	158333466
4060	NC_009925	TGC	2	6	232972	232977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333466
4061	NC_009925	ACG	2	6	232992	232997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333466
4062	NC_009925	GAG	2	6	233003	233008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333466
4063	NC_009925	ACTT	2	8	233009	233016	25 %	50 %	0 %	25 %	158333466
4064	NC_009925	ATC	2	6	233068	233073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333466
4065	NC_009925	GAT	2	6	233078	233083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333466
4066	NC_009925	AGT	2	6	233118	233123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333466
4067	NC_009925	AGA	2	6	233124	233129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333466
4068	NC_009925	ACAG	2	8	233197	233204	50 %	0 %	25 %	25 %	158333466
4069	NC_009925	TTC	2	6	233286	233291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333466
4070	NC_009925	TCC	2	6	233307	233312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333466
4071	NC_009925	CCAAA	2	10	233343	233352	60 %	0 %	0 %	40 %	158333466
4072	NC_009925	AGA	2	6	233409	233414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333466
4073	NC_009925	AGACA	2	10	233465	233474	60 %	0 %	20 %	20 %	158333466
4074	NC_009925	TC	3	6	233480	233485	0 %	50 %	0 %	50 %	158333466
4075	NC_009925	A	6	6	233581	233586	100 %	0 %	0 %	0 %	158333466
4076	NC_009925	AG	3	6	233589	233594	50 %	0 %	50 %	0 %	158333466
4077	NC_009925	A	6	6	233608	233613	100 %	0 %	0 %	0 %	158333466
4078	NC_009925	GCTG	2	8	233631	233638	0 %	25 %	50 %	25 %	158333466
4079	NC_009925	GCAC	2	8	233668	233675	25 %	0 %	25 %	50 %	158333466
4080	NC_009925	GACACC	2	12	233713	233724	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158333466
4081	NC_009925	TCGT	2	8	233781	233788	0 %	50 %	25 %	25 %	158333466
4082	NC_009925	TCA	2	6	233837	233842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333466
4083	NC_009925	T	6	6	233874	233879	0 %	100 %	0 %	0 %	158333466
4084	NC_009925	TCT	2	6	233906	233911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333466
4085	NC_009925	AGG	2	6	233973	233978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_009925	AGC	2	6	233988	233993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009925	TCAA	2	8	234124	234131	50 %	25 %	0 %	25 %	158333467
4088	NC_009925	ATCG	2	8	234160	234167	25 %	25 %	25 %	25 %	158333467
4089	NC_009925	TCTA	2	8	234207	234214	25 %	50 %	0 %	25 %	158333467
4090	NC_009925	TCA	2	6	234286	234291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333467
4091	NC_009925	TTGC	2	8	234330	234337	0 %	50 %	25 %	25 %	158333467
4092	NC_009925	GCA	2	6	234367	234372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333467
4093	NC_009925	TTG	2	6	234571	234576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333467
4094	NC_009925	TAA	2	6	234620	234625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333467
4095	NC_009925	TC	3	6	234634	234639	0 %	50 %	0 %	50 %	158333467
4096	NC_009925	GGC	2	6	234678	234683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333467
4097	NC_009925	CT	3	6	234866	234871	0 %	50 %	0 %	50 %	158333467
4098	NC_009925	T	6	6	234898	234903	0 %	100 %	0 %	0 %	158333467
4099	NC_009925	TCT	2	6	234943	234948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333467
4100	NC_009925	TGA	2	6	234964	234969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333467
4101	NC_009925	CCA	2	6	235036	235041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333467
4102	NC_009925	AAC	2	6	235047	235052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333467
4103	NC_009925	TGT	2	6	235064	235069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333467
4104	NC_009925	CAA	2	6	235241	235246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333467
4105	NC_009925	CCTT	2	8	235255	235262	0 %	50 %	0 %	50 %	158333467
4106	NC_009925	GACT	2	8	235291	235298	25 %	25 %	25 %	25 %	158333467
4107	NC_009925	AAC	2	6	235432	235437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333467
4108	NC_009925	GAA	2	6	235458	235463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333467
4109	NC_009925	A	6	6	235470	235475	100 %	0 %	0 %	0 %	158333467
4110	NC_009925	ACC	2	6	235527	235532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333467
4111	NC_009925	GGTA	2	8	235586	235593	25 %	25 %	50 %	0 %	158333467
4112	NC_009925	ATT	2	6	235755	235760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333467
4113	NC_009925	GA	3	6	235820	235825	50 %	0 %	50 %	0 %	158333467
4114	NC_009925	GCG	2	6	235913	235918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333467
4115	NC_009925	T	6	6	236310	236315	0 %	100 %	0 %	0 %	158333467
4116	NC_009925	GCT	2	6	236369	236374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333467
4117	NC_009925	GCTT	2	8	236494	236501	0 %	50 %	25 %	25 %	158333467
4118	NC_009925	CGA	2	6	236602	236607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333467
4119	NC_009925	GTCAAC	2	12	236713	236724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158333467
4120	NC_009925	ATTG	2	8	236747	236754	25 %	50 %	25 %	0 %	158333467
4121	NC_009925	CATC	2	8	236774	236781	25 %	25 %	0 %	50 %	158333467
4122	NC_009925	CAC	2	6	236782	236787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333467
4123	NC_009925	GAA	2	6	236790	236795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333467
4124	NC_009925	TGC	2	6	236915	236920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333467
4125	NC_009925	TCA	2	6	236950	236955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333467
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4127	NC_009925	CCG	2	6	237059	237064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333467
4128	NC_009925	TCG	2	6	237070	237075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333467
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4157	NC_009925	TTG	2	6	238764	238769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333467
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4246	NC_009925	T	7	7	243150	243156	0 %	100 %	0 %	0 %	158333474
4247	NC_009925	AGAT	2	8	243163	243170	50 %	25 %	25 %	0 %	158333474
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4498	NC_009925	CCT	2	6	256523	256528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333486
4499	NC_009925	CAT	2	6	256537	256542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333486
4500	NC_009925	TTG	2	6	256592	256597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333486

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